拳皇EX2游戏系统采取3对3的队伍战型式，玩家必须把对手队伍全员打倒才算获胜。游戏中将过去系列所使用的点数制废除，而改采审判系统（JUDGESYSTEM）的方式。这个系统会依照玩家获胜时的剩余时间与打倒对手、战胜所用的连续技、本身所受到的伤害值等要素来加算点数，玩..

拳皇EX2游戏系统采取3对3的队伍战型式，玩家必须把对手队伍全员打倒才算获胜。游戏中将过去系列所使用的点数制废除，而改采审判系统（JUDGESYSTEM）的方式。这个系统会依照玩家获胜时的剩余时间与打倒对手、战胜所用的连续技、本身所受到的伤害值等要素来加算点数，玩家只要储存满一定的点数便可以让游戏角色提升等级。等级共分八阶段，当达到最高等级时该角色就会变成所谓的「大师角色」，此时不但可以使用消耗3格能量条的「大师模式」，并可以藉由「大师模式」在一定时间内尽情使用超必杀技、连续技等技巧。由于玩家就算只玩一下也都能收集到点数，因此就算对格斗游戏不拿手的玩家也可以轻易练出大师级角色来游玩，不至于有怎么样都打不赢的情况出现。